代謝體中心統合台大醫學院代謝體中心和陽明交大VOCs分析實驗室，提供完整的微菌體代謝體分析服務，並配合各中心之需求發展新穎的代謝體分析技術。此平台可結合生醫產業的發展，適時調整分析服務的內容。
在代謝體分析的多方位發展可建立快速菌種與菌叢的預測。可協助相關保健食品上市增加產值，或協助醫學研究中微菌叢相關代謝分析，進而了解疾病關聯與成因、或提出新的常規檢測與治療方針，以提升台灣醫療水準，守護國人的健康。
不論是前期研究探尋，或是後期微菌叢植入治療效果確認，代謝體中心皆扮演重要的角色。預期之後分析案數量多，加上檢體與分析物性質不同，因此分別在陽明交大新竹校區與台大設立檢測單位，依檢體與分析物之性質分送至適合檢測單位，以提升案件處理效率。